MacMolPlt
від Brett Боде
Тепер у версії 7.4.3 для Mac OS X, Linux і Windows!
Боде, Б. і Гордон, MS J. Мовляв. Графіка Mod., 16 , 1998, 133-138.
MacMolPlt це:
- Сучасна графічна програма для побудови 3-D молекулярних структур і нормальних режимах (коливань). Сучасні засоби:
- Миша керований інтерфейс в режимі реального часу обертання і перекладу.
- Скопіюйте і вставте функціональність для взаємодії з іншими програмами, такими як текстові процесори або інших графічних програм (наприклад, ChemDraw).
- Проста печатка в кольорі або чорно-білі принтери (публікація якості).
- Відкривати кілька файлів одночасно.
- Вона читає файли різних форматів, включаючи будь-які вхідні GAMESS, журналу або IRC-файл безпосередньо для створення анімацій з IRC, в ДРК, і оптимізацій. Ви також можете імпортувати $ VEC групи з будь-яких файлів (таких, як GAMESS. Файл DAT). Крім того xMol XYZ файли, файли формату Молден і Chemical Markup Language (CML) файлів підтримуються. Крім того, деякі PDB файл підтримки і підтримки MDL MolFile включений.
- Молекулярна симетрії точкової групи підтримується.
- Ви також можете вставити GAMESS і Gaussian-92 стиль декартові координати безпосередньо в програмі.
- Анімація нормальних мод.
- Анімація IRC, і ДРК, в тому числі орбіталей.
- Простий ділянки енергії (в тому числі геометричних параметрів).
- Простий лінійний графік частоти в порівнянні з частотою ІЧ-порт або комбінаційного інтенсивності.
- Додавання декількох файлів GAMESS разом, щоб створити одну анімацію.
- Побудувати або зміни молекул за допомогою графічного будівельника молекули.
- Швидке створення реалістичних 3D-структур.
- обертати обрані атомів близько облігації, облігації або зміни двогранні кутів.
- переклад та обертати обрані підгрупи.
- Збірка молекули з нуля, використовуючи декартові або внутрішні координати
- 2D-орбіталі, загальна електронна щільність контурна карта дисплей
- 3D молекулярних орбіталей, загальна дисплей електронної густини
- Карти різниці щільності
- Молекулярного електростатичного потенціалу Карт
- Простий введення GAMESS (. ІЯФ) будівельникові
- 3D-кольоровий дисплей з освітленням і затіненням використанням OpenGL під MacOS X.
Нижче наведено кілька зразків, створених безпосередньо з MacMolPlt:
просте відображення молекули з етикетками і відображення кута зв'язку:
Вода з C 2v операторів.
Хинонов із загальною поверхневої густини електронів розфарбоване з молекулярного електростатичного потенціалу значення.
Розподілу
MacOS X:
- MacMolPlt 7.4.3 для MacOS X 10.4 і вище на PowerPC або Intel процесори (Universal Binary) ( )
- MacMolPlt 7.4.3 для MacOS X 10.4 і вище на PowerPC або Intel процесори (Universal Binary), з підтримкою чотирьохядерних буфер OpenGL ( )
- Єдине функціональне розходження між цими двома подвійних тому, що останній підтримує відображення апаратних стерео. Завдяки небагатьох, що залишилися глюків в 2,9 WX більшість користувачів повинні дотримуватися першого двійкового файлу.
Linux:
Ось вихідного дистрибутива в першу чергу орієнтовані на Linux: wxmacmolplt 7.4.3 ( )
Для отримання додаткової інформації по будівництву і готові файли, будь ласка, зверніться до сторінці підтримки Linux.
Windows:
- Більшість користувачів повинні використовувати цю Windows Installer (. MSI) пакет MacMolPlt 7.4.3 для ОС Windows ( )
- Ви повинні бути в змозі завантажити його і двічі клацніть його, щоб встановити MacMolPlt.
- Якщо ви не можете запустити програму установки в системі тут просто архів ZIP . Якщо wxMacMolPlt.exe файл не вдається запустити з повідомлення про те, конфігурація недійсною необхідно встановити VS8 бібліотек часу виконання. Просто запустіть файл пов'язаний тут .
- У Windows збірка повинна підтримувати чотирьохядерні буферний OpenGL.
Ці файли містять поточну версію MacMolPlt і керівництво (у форматі HTML).
Перевірте тут на список відомих проблем .
Натисніть, щоб підписатися на список розсилки оголошення про нові версії MacMolPlt. Зверніть увагу, цей список модерується і будуть використані лише для оголошення нових релізів.
У вас є питання, коментар або повідомити про помилку? Просто увімкніть його в розділі коментарів формі обстеження . Не забудьте вказати вашу адресу електронної пошти, якщо ви хочете отримати відповідь.
Якщо вам потрібна версія MacMolPlt для MacOS 9 і MacOS X 10.2 і більш ранніх версій ви можете отримати оригінальні MacMolPlt.
Пам'ятайте:
MacMolPlt безкоштовно, але якщо ви використовуєте його прошу Вас написати мені записку говорив мені, що ви хочете і що вам не подобається (Що не подобається ;-).
Якщо ви використовуєте MacMolPlt для роботи опубліковані відповідні посилання:
Боде, Б. і Гордон, MS J. Мовляв. Графіка Mod., 16 , 1998, 133-138.
Переведено з http://www.scl.ameslab.gov/~brett/MacMolPlt/
На головну
|